16S rDNA测序:是细菌分类学研究中最常用的“分子钟”,其序列包含9个可变区(Variable region)和10个保守区(constant region)。可变区因细菌而异,且变异程度与细菌的系统发育密切相关。通过检测16S rDNA的序列变异和丰度,可以了解环境样品中群落多样性信息。基于16S rDNA的分析在微生物分类鉴定、微生态研究等方面起到重要作用。一般用引物27F/1492R,PCR长度1500bp左右。
18S rDNA测序:18S rDNA为编码真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。在结构上分为保守区和高变区,保守区反映生物物种间的亲缘关系,高变区反映物种间的差异。一般用通用引物NS1/NS6,PCR长度1500bp左右。
ITS 测序:在真核生物中,18S rDNA和28S rDNA转录间隔序列称为ITS区。ITS分为两个区域:ITS1/ITS2,ITS1位于18S和5.8S之间,ITS2位于5.8S和28S之间。ITS由于是非转录区,承受的选择压力较小,变异强,目前已广泛用于真菌分类鉴定。在真菌测序中,使用ITS1和ITS4引物的组合可以扩增整个ITS区域,从而获取到足够的序列信息用于真菌物种的鉴定和分类分析。
26SrDNA测序:26SrDNA D1/D2区位于核糖体大亚基5’端,序列长度600bp左右,具有较高的变异率,可对亲缘关系较近的菌株进行分类学研究,一般用于酵母菌的分类鉴定。26S rRNA基因序列扩增引物为正向NL⁃1和反向引 物 NL⁃4。
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项目价格实验周期
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细菌200元/样5个工作日
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真菌300元/样7个工作日
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酵母菌300元/样7个工作日
- 单菌落培养后的平板、斜面及菌液
- 标准品菌种的菌粉
- 菌种基因组DNA 浓度20ng/ul,10ul以上
- 纯化好的单菌落培养液1ml,浓度大于10的6次方
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- 分离单菌落培养时,至少划板三次挑单菌进行培养。若菌种不纯,会造成套峰,测序失败
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- 我们不接受致病性菌,客户送的菌体带致病性,请客户灭活或者提供基因组DNA
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- 客户运输时请带冰袋运输,平板及斜面菌用封口膜封好,以免运输途中交叉污染
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- 建议不要寄送玻璃器皿。请将在玻璃器皿的菌株转移到塑料器皿内,再进行寄送。其他问题,请咨询客服人员
整合测序峰图、原始序列、比对数据表、进化树、鉴定结论,整理生成正式菌种鉴定检测报告,统一交付全部实验数据与资料。以下为NCBI序列比对结果及系统发育树。