DNase I footprinting是一种精确鉴定DNA结合蛋白（如转录调控蛋白）在DNA分子上的结合位点的检测方法。转录调控蛋白通过与启动子区域结合来调控靶标基因的转录。目前，凝胶阻滞实验（EMSA）和DNase I足迹分析实验是重要的一套体外研究工具：凝胶阻滞实验可以确定转录因子是否与DNA直接结合，而DNase I足迹分析实验则可以精确鉴定其结合的DNA序列，从而帮助我们研究基因转录调控的机制。经典的DNase I足迹分析实验需要使用同位素进行标记，不仅危险，而且费时、对操作者的技术要求高、成功率低。

曜源生物利用“荧光标记”结合ABI测序仪的方法来进行DNase I足迹分析实验。优点是：由于可以进行DNA的精确定量，并可以在常规的实验台上面操作；可重复性要远远好于同位素操作；ABI测序仪的操作体系非常成熟，灵敏度高，重复性好。因此，荧光标记法更灵敏度，获得的保护区域更清晰，图片的质量更好。