服务概述Service Overview
DNA条形码物种鉴定是依托标准化基因片段测序与数据库比对技术,快速、精准判定动植物样本物种身份的分子鉴定服务,其核心是利用生物体基因组中一段标准化、物种特异性强、变异适中的短基因片段,作为物种的“分子身份证”,通过测序、比对、分析完成物种鉴定,是传统形态学鉴定的重要补充与升级方案。本平台依托国际通用BOLD条形码数据库、NCBI核酸数据库及本土特色物种条形码资源,针对各类未知动植物样本,实现物种精准甄别,可解决形态残缺、幼体、碎片、加工制品等难以肉眼鉴定的物种识别难题。同时我公司针对15种常见哺乳动物细胞系的线粒体COI基因设计物种特异性引物,开发不同物种COI基因的多重荧光PCR-CE法,灵敏地检测细胞的种属以及不同种属的交叉污染情况,实现对其种属来源及种属间交叉污染的鉴定。
检测基因及通用引物Target Genes & Universal Primers
| 目标基因 | 引物名称 | 引物序列(5′→3′) | 扩增长度(bp) | 主要适用类群 | 备注 |
| 动物线粒体COI | LCO1490 HCO2198 |
GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA |
~658 | 绝大多数动物(昆虫、鱼类、哺乳类、鸟类等) | 最常用动物条形码,退火温度需根据模板和仪器微调 |
| 动物线粒体COI(短片段) | LCO1490 C1-N-2191 |
GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG CCCGGTAAAATTAAAATATAAACTTC |
~400 | 降解样本或旧标本 | 短扩增子,提高降解DNA成功率 |
| 动物线粒体16S rRNA | 16Sar 16Sbr |
CGCCTGTTTATCAAAAACAT CCGGTCTGAACTCAGATCACGT |
~550 | 两栖类、爬行类、部分鱼类及节肢动物 | 适用于COI扩增困难的类群 |
| 动物线粒体Cytb | Cytb_F Cytb_R |
CCATCCAACATCTCAGCATGATGAAA GCCCCTCAGAATGATATTTGTCCTCA |
~400 | 哺乳类、鸟类、鱼类 | 常用于物种鉴定及系统进化 |
| 植物叶绿体rbcL | rbcLa_F rbcLa_R |
ATGTCACCACAAACAGAGACTAAAGC GTAAAATCAAGTCCACCRCG |
~550 | 陆地植物(被子植物、裸子植物、蕨类) | 通用性强,扩增成功率高 |
| 植物叶绿体matK | matK-390F matK-1326R |
CGATCTATTCATTCAATATTTC TCTAGCACACGAAAGTCGAAGT |
~900 | 被子植物(尤其类群区分) | 进化速率较快,区分近缘种优于rbcL |
| 植物叶绿体trnH-psbA | trnH_F psbA_R |
CGCGCATGGTGGATTCACAATCC GTTATGCATGAACGTAATGCTC |
350~450 | 被子植物(属、种水平) | 非编码区,变异大,扩增短小 |
| 植物核糖体ITS | ITS1 ITS4 |
TCCGTAGGTGAACCTGCGG TCCTCCGCTTATTGATATGC |
500~700 | 植物(尤其属及属下水平)、真菌 | 常用辅助条形码,植物中常与叶绿体片段联用 |
注:表中为通用引物,如客户有特殊引物可以按客户提供要求引物检测。
技术路线Technical Workflow
01
DNA提取
02
PCR扩增
03
一代测序
04
序列比对
05
提交报告
服务价格Service Pricing
| 项目 | 检测方法 | 价格 | 实验周期 |
| 动物实体组织种属鉴定 | 选一对引物PCR测序比对 | 150-200元/样 | 5个工作日 |
| 植物实体组织种属鉴定 | 选一对引物PCR测序比对 | 200-300元/样 | 7个工作日 |
| 加工制品等种属鉴定 | 选一对引物PCR测序比对 | 300-400元/样 | 7个工作日 |
| 样品种属污染鉴定 | 不同物种COI基因的多重荧光PCR-CE法 | 800元/样 | 7个工作日 |
注:种属污染鉴定范围:人、小鼠、大鼠、中国仓鼠、叙利亚仓鼠、非洲绿猴、狗、牛、猪、兔、猫、猕猴、马、绵羊、山羊15个物种,检测灵敏度污染识别率1%。
样品说明Sample Specifications
涵盖各类动植物活体、组织碎片、残体、加工制品、幼体、卵、毛发、鳞片、植物叶片、根茎、种子、花粉等,可有效鉴定形态不完整、无典型鉴别特征的样本,微量样本即可满足检测需求。不适用的样品说明:
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- 样本严重降解、DNA完全破坏(如高温灼烧、长期霉变、强酸强碱浸泡样本),无法提取有效核酸的样本
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- 数据库无对应标准条形码序列的未知新物种、小众稀有物种,仅能判定高阶分类(科、属),无法精准到种级
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- 混样严重且无法分离单一物种组织的混合样本,无法实现精准单一物种鉴定
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- 人工杂交改良品种、人工培育变种,仅可判定亲本物种,无法区分人工改良品类
样本采集说明Sample Collection Instructions
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- 动物样本
- 优先选取肌肉、足部、鳞片、毛发等新鲜组织,样本量米粒大小即可,避免选取腐烂、霉变部位;昆虫优先选择完整成虫或胸部肌肉组织
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- 植物样本
- 选取新鲜、无病虫害的嫩叶、嫩茎或种子,避免老化、枯黄组织,保证样本完整性
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- 单一纯净
- 所有样本尽量单一纯净,避免混杂其他物种组织,防止干扰检测结果
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- 细胞沉淀
- 胞数≥5×10⁵个,15μL-2mL
样本保存与寄送Sample Storage & Shipment
- 新鲜样本可采用无水乙醇浸泡、低温冷藏方式保存,干冰或冰袋冷链寄送
- 干燥样本(植物干叶、昆虫干标本)可密封干燥保存,常温寄送
- 细胞样品干冰或普通冰袋运输
- DNA样品,浓度≥20ng/μL,体积≥20μL,OD260/280为1.8-2.0,冰袋运输
- 样本包装做好防漏、防污染处理,清晰标注样本编号与订单信息
报告内容Report Contents
官方正式检测报告包含:订单信息、样本基本信息、检测技术方案、目标基因片段、序列比对结果、相似度数据、物种分类鉴定结论、结果溯源依据。同时附带原始测序峰图、FASTA序列文件、数据库匹配详情。
联系方式CONTACT US